Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp5Q9D7S9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp5Q9D7S9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms