Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Cmtm5Q9D6G9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms