Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra4Q9D6F4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra4Q9D6F4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms