Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc81Q9D5W4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc81Q9D5W4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms