Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms