Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsph14Q9D3W1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms