Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D1K7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms