Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MrnipQ9D1F5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MrnipQ9D1F5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms