Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc5Q9D0F6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rfc5Q9D0F6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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