Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms