Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms