Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms