Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mis12Q9CY25 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mis12Q9CY25 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Mis12Q9CY25 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms