Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx7Q9CY18 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snx7Q9CY18 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms