Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sugt1Q9CX34 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sugt1Q9CX34 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms