Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Utp23Q9CX11 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms