Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddx28Q9CWT6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms