Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms