Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms