Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snw1Q9CSN1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snw1Q9CSN1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms