Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gnpda2Q9CRC9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gnpda2Q9CRC9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms