Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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1700029F12RikQ9CRB4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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