Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp5sQ9CRA7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp5sQ9CRA7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp5sQ9CRA7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms