Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras2Q9CR56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms