Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem42Q9CR22 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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