Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms