Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms