Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Smim8Q9CQQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms