Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpb2Q9CQI7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms