Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp3Q9CQ10 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp3Q9CQ10 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms