Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN0

Slc5a5, Sodium/iodide cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a5Q99PN0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc5a5Q99PN0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc5a5Q99PN0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms