Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcg5Q99PE8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg5Q99PE8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms