Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtn4Q99P72 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rtn4Q99P72 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms