Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rims1Q99NE5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rims1Q99NE5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms