Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdac9Q99N13 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hdac9Q99N13 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms