Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ms4a6bQ99N09 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a6bQ99N09 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ms4a6bQ99N09 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ms4a6bQ99N09 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ms4a6bQ99N09 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a6bQ99N09 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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