Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms