Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gdpd3Q99LY2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gdpd3Q99LY2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms