Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nus1Q99LJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nus1Q99LJ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms