Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp16Q99LG0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp16Q99LG0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms