Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab28Q99KL7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab28Q99KL7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab28Q99KL7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms