Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lims1Q99JW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lims1Q99JW4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms