Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnip2Q99JG7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip2Q99JG7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms