Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc33a1Q99J27 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc33a1Q99J27 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms