Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf144aQ925F3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf144aQ925F3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms