Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4ip1Q924D0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtn4ip1Q924D0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms