Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim7Q923T7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim7Q923T7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms