Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Supt16hQ920B9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt16hQ920B9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms