Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pde6cQ91ZQ1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pde6cQ91ZQ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms