Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Csde1Q91W50 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csde1Q91W50 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms